Tous les articles par Silvia Gervois

InfoExpress Mars 2017

> Renouvellement du GIS et Projet EOSC Pilot

Le conseil de groupement du Groupement d’Intérêt Scientifique France Grilles a décidé de prolonger celui-ci d’une année jusqu’au 31 décembre 2017.
Cette année supplémentaire doit permettre de définir avec tous les partenaires les contours d’une nouvelle Infrastructure de recherche en phase avec la restructuration des paysages national et international.

En effet, depuis le 1er janvier 2017, le projet EOSC Pilot, dont la France est partenaire, a entrepris de poser les fondations du European Open Science Cloud, appelé à fédérer les e-infrastructures en Europe.

En parallèle, EGI, EUDAT et INDIGO – DataCloud ont uni leurs forces pour déposer un projet commun en réponse à l’appel EINFRA12 « Data and Distributed Computing e-infrastructures for Open Science » qui clôt le 29 mars 2017. Jérome Pansanel coordonne la contribution française à ce projet avec le soutien de Volker Beckmann, nouveau représentant de la France au conseil d’EGI.

> EGI

> EUDAT

> Projet EOSC Pilot

> Appel EINFRA12

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> Formations Grille à l’INSERM

L’intérêt de la grille dans le domaine des sciences de la vie et de la santé ne fait plus de doute. Pourtant, au sein même de l’INSERM, le taux d’utilisation reste souvent faible.

Il y a maintenant trois ans voyait le jour, au DSI de l’INSERM, une équipe de Coordination de l’Informatique Scientifique (CISI).
Ses missions : soutenir et accompagner les unités de l’Institut dans les domaines du calcul, du HPC, de la grille, du cloud et du Big Data.
L’équipe organise en particulier des présentations d’informations, séminaires, démos et formations dans les différents domaines.

Dans ce cadre, une session de formation à la grille et plus particulièrement à l’utilisation de DIRAC a été donnée récemment au TAGC à Marseille (Inserm U1090). Les travaux de cette unité s’articulent autour des technologies d’analyses moléculaires à haut-débits et bioinformatique des réseaux biologiques pour l’étude des maladies et des processus de développement. Au coeur des recherches : l’analyse de données, dont certains aspects se prêtent parfaitement aux modèles d’analyse haut-débit tels que la grille.

Cette formation s’est déroulée en trois temps : Une session d’information tout d’abord, dont le but était de présenter les différents moyens de calcul existantes ; puis une session dédiée à la grille, présentant son historique, son fonctionnement et une démonstration d’utilisation ; et enfin, une formation pratique, permettant aux personnes présentes de s’initier à l’utilisation de DIRAC en manipulant eux-même.

Cette formation a été largement suivie, au-delà même de l’unité initialement visée puisqu’elle a regroupé des personnes de trois unités (INSERM et CNRS) du campus de Luminy.
Suite à cette formation, plusieurs stagiaires ont poursuivi sur leur lancée et ont intégré l’organisation virtuelle vo.france-grilles.fr pour travailler sur leur propre recherche dans l’environnement fourni par France Grilles.

Ce format d’intervention semble particulièrement adapté pour cibler efficacement le public potentiellement intéressé par une formation technique plus approfondie. C’est d’ailleurs ce format qui sera déroulé dans les prochains mois pour l’implémentation du plan calcul de l’INSERM, visant à favoriser l’utilisation par l’INSERM des ressources de calcul au niveau régional.

> INSERM

> TAGC à Marseille (Inserm U1090)

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> Cloud France Grilles en 2016

France Grilles propose depuis plus de deux ans l’accès à une fédération de Cloud IaaS basée sur OpenStack. Ce service permet de créer ses serveurs à la carte, en choisissant le nombre de coeurs, la quantité de RAM et l’espace disque, ainsi que le système d’exploitation. Les utilisateurs peuvent installer les logiciels scientifiques nécessaires à leur recherche et augmenter la puissance de leur serveur en fonction de leur besoin. Comme les autres services, il est ouvert à tous les chercheurs rattachés à une structure française, quelque soit son domaine scientifique.

L’année 2016 marque une étape importante dans l’utilisation de cette fédération, que ce soit par l’augmentation du nombre d’utilisateurs ou la quantité de ressources utilisées (plus d’un million d’heures CPU consommé). Les utilisateurs sont issus de communautés variées, telles que la biologie, la physique, l’agronomie ou les sciences de la vie.
Afin de répondre aux différents usages, de nouveaux services seront proposés en 2017, tel que les conteneurs (docker) à la demande.

Le service peut être utilisé en utilisant l’API OpenStack (détaillée dans la documentation France Grilles), ou au travers d’outils de plus haut niveau, tels que SlipStream et DIRAC. Il est prévu de réaliser plusieurs sessions de formations Utilisateurs au cours de cette année 2017, en proposant deux formats. Le premier, une introduction d’une demi-journée, permettra une rediffusion par visio-conférence, alors que le second, sur une durée de trois jours, permettra d’approndir l’utilisation du Cloud.

L’infrastructure se compose actuellement de 9 sites, dont 6 en production. L’un d’entre eux, l’IPHC, intégré à la fédération de Cloud EGI, fait parti du trio de tête des fournisseurs de ressources en 2016 dans EGI.
Deux ingénieurs prennent également part au développement du Cloud fédéré européen, en travaillant sur les thématiques de la sécurité et de la surveillance des infrastructures.

> Service FG-Cloud

> OpenStack

> Documentation collaborative

> SlipStream

> Service FG-DIRAC

> Cloud fédéré EGI

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> Journées SUCCES 2016

Les Journées SUCCES 2016 ont eu lieu dans les locaux de l’IPGP à Paris les 23 et 24 novembre 2016.

Organisées par les GIS France Grilles et GRID’5000, le Groupe Calcul et le GDR RSD, elles ont rassemblé les utilisateurs des mésocentres et des infrastructures de grilles ou de cloud autour d’exposés pléniers, de sessions dédiées aux posters, de démonstrations et de tables rondes sur des sujets d’actualité.

Les enregistrements, transparents et posters sont toujours accessibles en ligne.

Nous vous donnons rendez-vous pour la prochaine édition en 2017 !

> Site des Journées SUCCES 2016

> Vidéos des Journées SUCCES 2016

> GRID’5000

> Groupe Calcul

> GDR RSD

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> Conférence EGI et INDIGO-DataCloud

La Conférence EGI 2017 aura lieu à Catane, en Italie, du 9 au 12 mai 2017. Elle sera organisée en partenariat avec le « INDIGO Summit 2017 » et les deux événements seront hébergés par l’INFN-Catania.
L’appel à poster est ouvert jusqu’au 7 avril. Il n’a pas été possible d’organiser un espace de stands lors de cette conférence, aussi, nous vous invitons à contribuer largement à cet appel pour faire connaître vos travaux et vos réalisations.
Les inscriptions sont ouvertes (tarifs early birds jusqu’au 31 mars) et l’équipe France Grilles compte bien vous y rencontrer !

> Conférence EGI et INDIGO-DataCloud

> Inscriptions en ligne

> INDIGO – DataCloud

> EGI

> INFN-Catania

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Ingénieur d’études en informatique

L’Université Pierre et Marie Curie (UPMC) propose un poste d’ingénieur d’études en informatique affecté au LPNHE Paris et à l’Institut des Sciences du Calcul et des données (ICS) de l’UPMC.
Les activités concerneront essentiellement du support utilisateur pour le portage d’applications sur la grille et des clusters HPC.
Concours externes des ITERF : Inscriptions du 30 mars 2016 au 27 avril 2016.

Le descriptif du poste et les modalités d’inscription sont disponibles ici.

Inscriptions Formation utilisateur DIRAC iRODS

France Grilles
France Grilles

France Grilles organise, du lundi 7 mars au mercredi 9 mars dans les locaux du Centre de Calcul de l’IN2P3 à Villeurbanne une formation utilisateur DIRAC et iRODS.

Les inscriptions sont ouvertes et accessibles en ligne.

Le nombre de places étant limité à 12 personnes, toute inscription vous engage sur votre présence.
En cas d’impossibilité majeure, merci de nous tenir au courant rapidement afin de réattribuer la place.

Nous vous rappelons que le coût de la formation est pris en charge par France Grilles mais que votre mission reste à la charge de votre laboratoire.

InfoExpress Janvier 2016


Je voudrais vous présenter ainsi qu’à tous ceux qui vous sont chers mes meilleurs vœux.
La vocation de France Grilles est de fournir, sur des infrastructures de calculs et de stockage distribuées,une offre de services adaptée aux besoins des utilisateurs, qu’ils soient issus de communautés structurées ou de communautés émergentes. La France est impliquée dans plusieurs centres de compétences (CC-LifeWatch, CC-ELIXIR, CC-EPOS) dans le cadre du projet européen EGI-ENGAGE. Ce projet est l’opportunité de développer les contacts avec les infrastructures européennes de recherche.
L’organisation virtuelle France Grilles accueille aussi depuis 3 ans les utilisateurs des nouvelles communautés et leur offre un ensemble de services : portail FG-DIRAC pour la soumission des tâches, fédération FG-iRODS pour le stockage distribué des données. L’année 2015 a été marquée par l’entrée de l’Organisation Virtuelle France Grilles dans le top 10 des VOs d’EGI. Son succès montre que le modèle que nous développons pour accueillir des nouveaux utilisateurs est pertinent et qu’il doit être poursuivi et éventuellement élargi au niveau européen.
Au cours de l’année écoulée, les utilisateurs français ont aussi grappillé plus de 80 millions d’heures CPU normalisées hors de France sur l’infrastructure EGI. Ils l’ont fait notamment via des portails web, comme le portail VIP de CREATIS pour la simulation et l’analyse d’images médicales, qui a continué sa croissance impressionnante, offrant aujourd’hui ses services à plus de 850 utilisateurs.
Si l’infrastructure de grille a continué fidèlement d’accueillir plus d’un millier d’utilisateurs français, la fédération de clouds académiques continue aussi sa montée en puissance. L’an dernier, la France a officiellement rejoint la fédération de Cloud EGI, grâce au site de l’IPHC à Strasbourg. La fédération de clouds académiques France Grilles regroupe aujourd’hui 8 sites, dont 6 en production. Le cloud apporte de nouveaux défis en termes de sécurité des systèmes d’information. France Grilles joue un rôle d’animation et de coordination des actions des établissements en matière de sécurité informatique des infrastructures distribuées. Une analyse des risques de la grille a ainsi été conduite avec succès dans le cadre d’un partenariat avec l’Agence Nationale de Sécurité des Systèmes Informatiques.
L’excellente nouvelle reçue en fin d’année dernière est le renouvellement du classement comme Infrastructure de Recherche de France Grilles. Dans les prochains mois, le Comité Scientifique et le Conseil de Groupement vont réfléchir à l’évolution de son rôle dans le contexte de la recomposition du paysage national des infrastructures numériques. Dans le contexte de la croissance très rapide des besoins de stockage et d’analyse des données de la science, ces infrastructures sont appelées à se parler et à développer des services communs. Les journées SUCCES ont été l’occasion de mesurer le rapprochement des communautés des utilisateurs du calcul à haut débit et du calcul intensif ainsi que les opportunités de collaboration avec la communauté de recherche en informatique.
La nouvelle année s’accompagne aussi d’une nouvelle version du site web de France Grilles. Un grand merci à Silvia Gervois qui en a fait la conception graphique.
Dans ce contexte riche de défis et d’opportunités, l’équipe d’animation de France Grilles se joint à moi pour vous souhaiter à tous et toutes une excellente année 2016.
Vincent BRETON

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> France Grilles renouvelée en tant qu’Infrastructure de Recherche


France Grilles a été renouvelée en tant qu’Infrastructure de Recherche, fin 2015, dans le cadre de la nouvelle feuille de route par le comité des TGIR.

Nous sommes heureux de partager cette bonne nouvelle avec toute la communauté France Grilles qui participe à la réussite et à la reconnaissance de notre infrastructure.

Merci à vous !

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> france-grilles.fr fait peau neuve !

Dans ce monde en perpétuel changement, france-grilles.fr évolue pour répondre toujours mieux à vos attentes.

Nous avons donc repensé complètement notre site web dans ce sens.

Retrouvez toutes nos offres de services, les dernières news de la communauté mais aussi les formations France Grilles à l’affiche !

> Visitez le site ici

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> EGI Community Forum, Bari, Italie

De même que lors des autres éditions, le dernier forum EGI de Bari a été un franc succès pour toute la communauté France Grilles.

Le stand France Grilles est toujours le point de rencontre de tous ses membres, lieu de convivialité et d’échanges fructueux.

Un grand merci à Luisa Arrabito pour son aide dans l’organisation du repas des français qui a réuni 15 personnes autour d’antipasti gargantuesques !

Le programme du forum a, lui aussi, été riche avec, notamment un tutoriel DIRAC, proposé par Andreï Tsaregorodtsev, un Security Training, quatre sessions parallèles consacrées aux travaux des différents « Competences centres » et communautés scientifiques associées, des sessions consacrées à la « long tail of science » avec par exemple une présentation de VIP par Sorina Pop.

Pour retrouver le programme complet du forum, visitez la page dédiée en ligne.

> EGI Community Forum, Bari

> Programme du forum

> Tutoriel DIRAC

> Présentation de VIP

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> 11èmes jres, Montpellier

Les 11e jres se sont déroulées pour la deuxième édition au Corum de Montpellier.

Le stand France Grilles, mis à disposition gracieusement par les organisateurs, a accueilli un grand nombre de visiteurs.

Servant de support à de nombreux posters apportés par la communauté ou décrivant les principaux services France Grilles, il a été le lieu de prises de contacts et d’échanges très intéressants.

Les services FG-Cloud et FG-iRODS de France Grilles ont été présentés pendant les jres. Vous pouvez retrouver les articles, présentations et les « lives » sur la page du programme des jres.

> 11e jres, Montpellier

> Programme des 11e jres

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Rappel :

> Second workshop EGI on the Open Science Cloud :
5 février 2016

Rome, Italie

Inscriptions sur la page de l’événement avant le 29 janvier.

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France Grilles en chiffres (2015)

Les chiffres-clefs de 2015

(mis à jour en décembre 2015)

Cloud

  • Nombre total de sites: 9 (dont 1 planifié pour 2016)
  • Nombre de sites en production: 6
  • Nombre de sites intégrés à la fédération EGI: 1
  • Ressources de calcul: 2000 coeurs
  • Ressources de stockage: 100 TOctets

Grille

  • Nombre de sites en France: 12
  • Ressources de calcul: 41231 coeurs
  • Ressources de stockage sur disque: 24,2 POctets
  • Nombre d’heures CPU normalisées (KSI2K) fournies par la France à EGI: 645 Millions, soit 13,9% des ressources

Contribution de la France à EGI par rapport aux autres pays (source: EGI accounting portal, http://accounting.egi.eu)

Contribution de chacun des sites français aux ressources fournies par la France à EGI

Utilisateurs

Distribution des utilisateurs de la grille par discipline

utilisateurs par discipline

Fraction des ressources françaises utilisée par chacune des 10 principales organisations virtuelles

Origine géographique des utilisateurs des ressources françaises

Origine géographique des ressources consommées par les utilisateurs titulaires de certificats français

Performances:

  • disponibilité (pourcentage de temps pour lequel l’ensemble des services grilles d’un site donné est fonctionnel et disponible) : >99%
  • fiabilité (pourcentage de temps pour lequel l’ensemble des services grilles d’un site donné est fonctionnel et disponible sans tenir compte des maintenances et indisponibilités prévues): >99%

 

 

Production scientifique: http://hal.archives-ouvertes.fr/FRANCE-GRILLES