InfoExpress Mars 2017

> Renouvellement du GIS et Projet EOSC Pilot

Le conseil de groupement du Groupement d’Intérêt Scientifique France Grilles a décidé de prolonger celui-ci d’une année jusqu’au 31 décembre 2017.
Cette année supplémentaire doit permettre de définir avec tous les partenaires les contours d’une nouvelle Infrastructure de recherche en phase avec la restructuration des paysages national et international.

En effet, depuis le 1er janvier 2017, le projet EOSC Pilot, dont la France est partenaire, a entrepris de poser les fondations du European Open Science Cloud, appelé à fédérer les e-infrastructures en Europe.

En parallèle, EGI, EUDAT et INDIGO – DataCloud ont uni leurs forces pour déposer un projet commun en réponse à l’appel EINFRA12 « Data and Distributed Computing e-infrastructures for Open Science » qui clôt le 29 mars 2017. Jérome Pansanel coordonne la contribution française à ce projet avec le soutien de Volker Beckmann, nouveau représentant de la France au conseil d’EGI.

> EGI

> EUDAT

> Projet EOSC Pilot

> Appel EINFRA12

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> Formations Grille à l’INSERM

L’intérêt de la grille dans le domaine des sciences de la vie et de la santé ne fait plus de doute. Pourtant, au sein même de l’INSERM, le taux d’utilisation reste souvent faible.

Il y a maintenant trois ans voyait le jour, au DSI de l’INSERM, une équipe de Coordination de l’Informatique Scientifique (CISI).
Ses missions : soutenir et accompagner les unités de l’Institut dans les domaines du calcul, du HPC, de la grille, du cloud et du Big Data.
L’équipe organise en particulier des présentations d’informations, séminaires, démos et formations dans les différents domaines.

Dans ce cadre, une session de formation à la grille et plus particulièrement à l’utilisation de DIRAC a été donnée récemment au TAGC à Marseille (Inserm U1090). Les travaux de cette unité s’articulent autour des technologies d’analyses moléculaires à haut-débits et bioinformatique des réseaux biologiques pour l’étude des maladies et des processus de développement. Au coeur des recherches : l’analyse de données, dont certains aspects se prêtent parfaitement aux modèles d’analyse haut-débit tels que la grille.

Cette formation s’est déroulée en trois temps : Une session d’information tout d’abord, dont le but était de présenter les différents moyens de calcul existantes ; puis une session dédiée à la grille, présentant son historique, son fonctionnement et une démonstration d’utilisation ; et enfin, une formation pratique, permettant aux personnes présentes de s’initier à l’utilisation de DIRAC en manipulant eux-même.

Cette formation a été largement suivie, au-delà même de l’unité initialement visée puisqu’elle a regroupé des personnes de trois unités (INSERM et CNRS) du campus de Luminy.
Suite à cette formation, plusieurs stagiaires ont poursuivi sur leur lancée et ont intégré l’organisation virtuelle vo.france-grilles.fr pour travailler sur leur propre recherche dans l’environnement fourni par France Grilles.

Ce format d’intervention semble particulièrement adapté pour cibler efficacement le public potentiellement intéressé par une formation technique plus approfondie. C’est d’ailleurs ce format qui sera déroulé dans les prochains mois pour l’implémentation du plan calcul de l’INSERM, visant à favoriser l’utilisation par l’INSERM des ressources de calcul au niveau régional.

> INSERM

> TAGC à Marseille (Inserm U1090)

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> Cloud France Grilles en 2016

France Grilles propose depuis plus de deux ans l’accès à une fédération de Cloud IaaS basée sur OpenStack. Ce service permet de créer ses serveurs à la carte, en choisissant le nombre de coeurs, la quantité de RAM et l’espace disque, ainsi que le système d’exploitation. Les utilisateurs peuvent installer les logiciels scientifiques nécessaires à leur recherche et augmenter la puissance de leur serveur en fonction de leur besoin. Comme les autres services, il est ouvert à tous les chercheurs rattachés à une structure française, quelque soit son domaine scientifique.

L’année 2016 marque une étape importante dans l’utilisation de cette fédération, que ce soit par l’augmentation du nombre d’utilisateurs ou la quantité de ressources utilisées (plus d’un million d’heures CPU consommé). Les utilisateurs sont issus de communautés variées, telles que la biologie, la physique, l’agronomie ou les sciences de la vie.
Afin de répondre aux différents usages, de nouveaux services seront proposés en 2017, tel que les conteneurs (docker) à la demande.

Le service peut être utilisé en utilisant l’API OpenStack (détaillée dans la documentation France Grilles), ou au travers d’outils de plus haut niveau, tels que SlipStream et DIRAC. Il est prévu de réaliser plusieurs sessions de formations Utilisateurs au cours de cette année 2017, en proposant deux formats. Le premier, une introduction d’une demi-journée, permettra une rediffusion par visio-conférence, alors que le second, sur une durée de trois jours, permettra d’approndir l’utilisation du Cloud.

L’infrastructure se compose actuellement de 9 sites, dont 6 en production. L’un d’entre eux, l’IPHC, intégré à la fédération de Cloud EGI, fait parti du trio de tête des fournisseurs de ressources en 2016 dans EGI.
Deux ingénieurs prennent également part au développement du Cloud fédéré européen, en travaillant sur les thématiques de la sécurité et de la surveillance des infrastructures.

> Service FG-Cloud

> OpenStack

> Documentation collaborative

> SlipStream

> Service FG-DIRAC

> Cloud fédéré EGI

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> Journées SUCCES 2016

Les Journées SUCCES 2016 ont eu lieu dans les locaux de l’IPGP à Paris les 23 et 24 novembre 2016.

Organisées par les GIS France Grilles et GRID’5000, le Groupe Calcul et le GDR RSD, elles ont rassemblé les utilisateurs des mésocentres et des infrastructures de grilles ou de cloud autour d’exposés pléniers, de sessions dédiées aux posters, de démonstrations et de tables rondes sur des sujets d’actualité.

Les enregistrements, transparents et posters sont toujours accessibles en ligne.

Nous vous donnons rendez-vous pour la prochaine édition en 2017 !

> Site des Journées SUCCES 2016

> Vidéos des Journées SUCCES 2016

> GRID’5000

> Groupe Calcul

> GDR RSD

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> Conférence EGI et INDIGO-DataCloud

La Conférence EGI 2017 aura lieu à Catane, en Italie, du 9 au 12 mai 2017. Elle sera organisée en partenariat avec le « INDIGO Summit 2017 » et les deux événements seront hébergés par l’INFN-Catania.
L’appel à poster est ouvert jusqu’au 7 avril. Il n’a pas été possible d’organiser un espace de stands lors de cette conférence, aussi, nous vous invitons à contribuer largement à cet appel pour faire connaître vos travaux et vos réalisations.
Les inscriptions sont ouvertes (tarifs early birds jusqu’au 31 mars) et l’équipe France Grilles compte bien vous y rencontrer !

> Conférence EGI et INDIGO-DataCloud

> Inscriptions en ligne

> INDIGO – DataCloud

> EGI

> INFN-Catania

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